Виртуальные серверы функционируют на основе не только наиболее распространенных операционных систем Windows и Linux. Программными разработчиками во всем мире ведется активная деятельность по созданию альтернативных операционных систем, адаптированных к специфике решения тех или иных технических задач, либо достаточно универсальных по применению.